Formation eGene : enjeux de la génomique et apports de la bio-informatique

Résumé de la formation

  • Type de diplôme: Certificat
  • Domaines de compétences: Agronomie et Agriculture

Présentation

Présentation

Formation également accessible en Anglais, pensez à le mentionner auprès de votre conseiller en formation

 

eGENE couvre la génétique, la génomique et la bioinformatique de tous les organismes vivants, depuis les virus, les microorganismes, les plantes, les animaux, jusqu’à l’homme. 
La génomique est une discipline de la biologie moderne qui a pour objet l'étude du fonctionnement d'un organisme à l'échelle de son génome. 

La bio-informatique est constituée par l'ensemble des concepts et des techniques nécessaires à l'interprétation informatique de l'information biologique générée en génomique.

Objectifs

  • eGENE consiste à former les ingénieurs à la démarche intellectuelle et aux techniques expérimentales liées à la génomique et l’analyse des données qu’elle génère.
  • Former les ingénieurs aux techniques informatiques liées aux traitements et à l’intégration des données issues des approches globales à haut débit comme la génomique et la post génomique et à la biologie computationnelle.
  • La mise en pratique des démarches sera réalisée par l’analyse concrète de problématiques biologiques.

 

Méthodes pédagogiques

Cours et travaux dirigés, travaux pratiques et visites de plateformes, intervenants extérieurs

Contrôle des connaissances

La note totale du module se décompose en deux évaluations :
50% de la note est établie par une synthèse d’article et présentation orale
50% de la note vient de compte-rendu de travaux et de projets.

Responsable de la formation :

F. REGAD

Programme

Contenu de la formation

Unité 1 : Structure du génome

Les grands projets de séquençage génomique, les technologies de séquençages de nouvelle génération et stratégie de séquençage associées

Unité 2 : Transcriptome

Les analyses à haut débit de l’expression génique : PCR quantitative, RNA-seq et expérimentation.

Unité 3 : Protéome et Métabolome

  • Les méthodologies d’analyses en masse des protéines : l’approche protéomique.
  • Les méthodologies d’analyses en masse des métabolites : l’approche métabolomique.

Unité 4 : Exploration fonctionnelle

La génomique fonctionnelle et les stratégies pour décrypter la fonction des gènes.

Unité 5 : Premiers pas en bioinformatique

Initiation à l’environnement UNIX/LINUX. Programmation en bioinformatique et programmation structurée.

Unité 6 : Bioinformatique des séquences

  • Banque de données généralistes et spécialisées. Analyse et comparaison de séquences.
  • Caractérisation de familles de protéines, structure et phylogénie.

Unité 7 : Bioinformatique pour la génomique et la post-génomique

Méthodes d’annotation de génomes. Traitement les données issues des approches expérimentales à haut débit.

Admission

Condition d'accès

Personnes concernées : 

Ingénieurs, Techniciens supérieurs

Prérequis :

Bac+2

Contact(s)

Lieu(x) de la formation

  • Auzeville-Tolosane

Contact(s) administratif(s)

Conseiller Formation Qualifiante

Tél : 05 34 32 31 07

Email : qualifiant.fc @ inp-toulouse.fr

Plus d'infos

Crédits ECTS 4 crédits

Public concernéFormation continue, Formation continue non diplômante, Formation professionnelle

Formation à distance Non

Nature de la formation
Certification

Durée du stage 70 h

Coût de la formation 1000 €

Date(s) de la formation du 17/02/2022 au 25/03/2022

Nous contacter

Toulouse INP Formation Continue

6 allée Emile Monso - BP 34038
31029 Toulouse Cedex 4
Ouvert du lundi au vendredi

08h30-12h30 / 13h30-16h30

05 34 32 31 08

Contacts

Le centre de formation continue et professionnelle des Grandes Écoles d'Ingénieurs de Toulouse INP

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